對于一般的底部過濾，水流經(jīng)較小區(qū)域的礫石頂部，礫石層之間的空間更寬敞。低于一層的每一層礫石的面積和空間變得更大且更寬敞。這種設(shè)計安排是為了提供更大的表面積并減慢淤積速度。如果底層太淤，則需要從相反方向過濾水流。該設(shè)備的范圍向后噴灑，因此大部分雜質(zhì)將被沖洗掉。

底部過濾器是基于此概念而制成的。將足夠厚的礫石放在多孔的塑料板上，水將通過塑料板后面的立管從板下方排出。塑料板下面的水流立即被流過礫石層的水代替。同時，氮化物細菌也開始聚集在大部分礫石層上。結(jié)果，水中的細菌數(shù)量足以進行生物過濾過程。

潛水泵廠家為了確保足夠的水流，將氣石裝置放置在立管的底部，以形成氣泡水流，將水推到地面。當(dāng)氣石和氣泵產(chǎn)生大量氣泡時，流經(jīng)底部過濾器的水足以滿足細菌的應(yīng)用。但是，長期使用后，氣石裝置會堵塞許多雜質(zhì)，極大地影響性能。同時，氣泵的壓力也增加，導(dǎo)致水和氣泡的流動減慢，這降低了生物過濾的效率。

氣石的替代品是潛水泵，它只是一個裝在密封塑料蓋中的小型電動機。將其安裝在上升管的頂部時，水將通過螺旋槳的旋轉(zhuǎn)而被吸到管中。除了定期清潔潛水泵的螺旋槳翼上的雜質(zhì)外，不需要采取其他維護措施。為了減少雜質(zhì)在礫石層上的積聚并影響水流量，一些水族館愛好者會逆轉(zhuǎn)底部過濾器的水流量。從底層過濾出的水流經(jīng)立管，然后進入濾板的底部，然后在礫石層范圍內(nèi)上升。最常用的反向水流操作方法是使用帶有連接裝置的潛水泵。因此，水流可以先通過一個小的海綿過濾器，然后進入潛水泵，然后向下推入立管。但是，必須清潔海綿，以確保沒有雜質(zhì)使水暢通無阻。另外，一些魚友選擇外部筒式過濾器與底部過濾器配合以產(chǎn)生倒流性能。但是，由于該設(shè)備的外部盒式過濾器既費時又費力，并且泵體內(nèi)的水流會引起摩擦，這將嚴(yán)重影響外部盒式過濾器。設(shè)備的正常流速。因此，使用潛水泵作為動力源是最有效的。